婉茹打电话到保密局找娄海平得到正在医院执行任务。婉茹说自己出去买菜回来发现燕公馆外有可疑的人求娄海平帮忙。娄海平正说着有人跑来报告娄海平燕文川被抓了并且保姆可能也是共党。婉茹听到后立刻挂了电话。娄海平跑回保密局告诉老四文川被抓了，玉兰也是嫌疑犯。
燕文川被姚鼎秋和廖忠虎打个半死。娄海平和老四到了陈恭如办公室。两人都为燕文川说话不相信燕文川是共党但现在证据对燕文川很不利陈恭如不会这么放了燕文川。两人走后陈恭如又命人勘察燕文川用过娄海平的车。娄海平和老四去牢里看到被打的半死的燕文川。姚鼎秋指出新民主主义的书和共党用的枪是哪来的。燕文川一一回应。姚鼎秋又问燕文川那又鞋怎么回事。燕文川指出自己家里被盗了一定是有人要陷害他。
老余在医院里监视着程雅芝很快便找到日本特务的秘密联络点。陈恭如接到上级命令他只有半个月的时间破获海蛇案，陈恭如有些后悔不该这么早抓了燕文川。为了党国利益他必须亲自出马和燕文川做个交易。小唐回来汇报陈恭如车里没有任何发现，燕文川喝多了车已经被彻底清洗过。
娄海平和老四到了燕公馆发现燕文川家的保险箱不见了，这一切都是燕文川安排唐世雄所做。燕文川还安排唐世雄买和自己一样的皮鞋在江边留下了脚印。娄海平和老四在江边发现了空保险箱并且还发现了一件衣服，老看着衣服像燕文川的。
婉茹要救燕文川想给雷小冉打个电话，这也提醒了老马雷家和燕家可是世交。陈恭如带了酒去见燕文川，陈恭如让燕文川答应他一个条件不管他承认不承认自己是共产党都会马上放了他。陈恭如让燕文川答应继续帮他破海蛇案。娄海平和老四回来了，雷振山也带着小冉来了。小冉看到燕文川被打的那个样当场把陈恭如拉出去告诉他中午自己和文川在一起。陈恭如下令把燕文川带回保密局。
回到保密局后娄海平和老四把自己在江边查到的证据当场汇报了。陈恭如下令马给燕文川恢复名誉并让姚鼎秋和廖忠虎给燕文川赔礼道歉。陈恭如这时候又接到汇报在医院的那名巡警死了。娄海平和老四去了医院。巡警是因为葡萄糖注射液中氯化钾过高而死。这也是燕文川安排唐世雄做的。
神秘人质第12集剧情介绍蔡老四分析如果不是配药房出了问题被调包的可能性基本没有。老四和娄海平可以结案了就是小护士刚来药放多了。
姚鼎秋和廖忠虎给燕文川道歉，陈恭如也假模假样的说只是个误会要亲自把燕文川送回家。
回到家小冉还愤愤不平说保密局的人真坏，燕文川问她是怎么知道自己出事的。小冉说是玉兰告诉她的。燕文川让小冉先回家吧。临走时小冉把自己照片送给文川放到了他钱包里让燕文川没事的时候多想她。经历了这次可怕的教训燕文川决定要把冒失的婉茹调走。
燕文川发了电报让婉茹赶快回家。婉茹回来了也很自责。
娄海平和老四把在医院调查的结果告诉了陈恭如没有发现任何疑点，初步判断是护士周美萍拿错了药。陈恭如问娄海平和老四谁最像内鬼，老四指出理论上谁都有可能。
第二天燕文川带着眼镜迷迷瞪瞪的来到了保密局结果连门都进错了。唐凤看到后对燕文川说以后需要有她帮忙的尽管开口。原来燕文川根本就不是近视。
燕文川去医院见了唐世雄，唐世雄是个汉子义字当先告诉燕文川把他保险箱里的东西埋在他家后花园了并且唐世雄不管燕文川是什么人他认定了燕文川是他朋友。
老四找人翻译的小提曲弄出来了让人赶紧打电话告诉燕文川。
老马和婉茹说要把燕文川发展成自己的同志，这时接到燕文川的电话乐谱破译了要他们马上行动。
按照燕文川的计划老余等人装成警察到日本人的联络点松山医院。按照计划老余是要赶在保密局的人之前拿走档案并且把该下的套下好。此时的松本还是拉在小提琴和程雅芝做最后的告别，所有数据已经传送完毕。
程雅芝离开的时候一切都被燕文川和老四监视在眼里看到她把纸条放到石头下被人取走，取走纸条的人是燕文川安排的，把老四引到了松山书院。
陈恭如开会和大家宣布海蛇案基本已经告破了，此时最大功臣是燕文川让燕文川和大家说说破案的经过。燕文川首先讲述了自己看破松本装疯又把发现程雅芝的事告诉大家。
陈恭如在开会的同时老马按照燕文川的安排到了医院拿走了松本拉琴的录音。
老四又把发现松山书店的告诉了陈恭如，陈恭如下令马上行动。
老徐和同志在书店内做好布置后便撤走了。另一边的程雅芝也要出院离开了。护士报告给了在医院的娄海平和燕文川。
